(Proyecto) Uso de técnicas moleculares de nueva generación con fines estratégicos en la República Dominicana.
(Proyecto) Uso de técnicas moleculares de nueva generación con fines estratégicos en la República Dominicana.
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Date
2026
Authors
Agripina Ramírez
Luis Matos
Rosa María Ros Espín
Olaf Werner
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Abstract
El proyecto presentado tiene como objetivo principal el formar investigadores dominicanos en las más modernas técnicas de genética molecular, lo que se realizará en estrecha colaboración con investigadores con amplia experiencia de la Universidad de Murcia (España). Se ha articulado para su ejecución en base a dos subproyectos sobre plantas que presentan problemáticas diferentes en la República Dominicana. En el primero se estudiará la diversidad genómica de los cultivares del género Musa (plátanos y bananos) en relación con la plaga del hongo Sigatoka negra. Se secuenciará el genoma completo tanto en cultivares resistentes como en otros susceptibles al ataque del hongo para determinar las diferencias genéticas entre ambos grupos. También se secuenciará el transcriptoma en muestras control y en plantas infectadas para monitorizar la transcripción diferencial entre las dos condiciones, así como el ADN genómico tratado con bisulfito, para obtener información sobre cambios de la metilación de citosinas (epigenoma), los cuales pueden influir a nivel de transcripción y aunque en principio son reversibles pueden heredarse. En el segundo sub-proyecto se estudiará la diversidad del género Pimenta (canelillas) en la República Dominicana, el cual incluye especies de gran interés económico para el país por su contenido en aceites esenciales, incluso algunas de ellas están incluidas en la Lista Roja de Plantas Vasculares de la República Dominicana. Se estudiará la delimitación de especies y la diversidad genética intraespecífica mediante la técnica Genotyping by Sequencing, así como el transcriptoma con el objetivo de identificar los genes responsables de la producción de aceites esenciales.
Description
Objetivo General:
El objetivo general del proyecto es formar a científicos dominicanos en la aplicación de técnicas de secuenciación masiva.
Dado que el proyecto se ha articulado para su ejecución en dos subproyectos, cada uno de los cuales aborda diferentes problemáticas en plantas de la República Dominicana, planteamos a su vez sus respectivos objetivos generales:
Subproyecto 1: Ccaracterizar mediante técnicas secuenciación masiva la reacción de diferentes cultivares de Musa en infecciones con el hongo Sigatoka negra y esclarecer mecanismos de defensa.
Subproyecto 2: Conocer la diversidad dentro del género Pimenta en la República Dominicana.
Objetivos específicos:
1.) Resecuenciar el genoma completo de 30 muestras de Musa y comparar las secuencias obtenidas entre variedades de Musa resistentes al hongo Sigatoka negra y variedades susceptibles a la infección para encontrar indicios de qué genes podrían ser responsables de la resistencia.
2.) Secuenciar el ARNm (transcriptoma) en muestras de Musa susceptibles y resistentes al hongo en condiciones de control y en hojas infectadas con el fin de identificar los genes activados y los genes desactivados después de una infección en plantas de Musa resistentes y susceptibles a la infección por el hongo.
3.) Secuenciar el metiloma al igual que en el caso del transcriptoma y buscar genes con una señal de metilación diferencial entre las plantas de Musa resistentes y las susceptibles a la infección por el hongo.
4.) Cruzar los datos de transcriptoma y metiloma para encontrar posibles correlaciones.
5.) En el caso del género Pimenta usar los datos de GBS para delimitar con especialistas en morfología de la República Dominicana las especies presentes en el país.
6.) Establecer la variabilidad genética presente en cada taxón reconocido y aceptado de Pimenta.
7.) Averiguar cómo se reparte la variabilidad genética a nivel espacial en las especies de Pimenta, es decir responder a preguntas como ¿Hay diferencias dentro de cada especie entre las poblaciones? ¿Hay poblaciones más diversas genéticamente que otras?
8.) Elaborar planes de gestión de las especies de Pimenta basados en los datos genéticos.
9.) Conocer los genes responsables de la formación de los aceites esenciales en el género Pimenta.