Investigación

Permanent URI for this community

https://repositoriovip.uasd.edu.do/handle/123456789/3

Browse

Browsing Investigación by Author "César A. Díaz Alcántara"

Now showing 1 - 7 of 7
  • Item
    Analysis of rhizobial strains nodulatingPhaseolus vulgaris from Hispaniola Island, a geographic bridge between Meso and South America and the first historical link with Europe
    (2014-03) César A. Díaz Alcántara
    Hispaniola Island was the first stopover in the travels of Columbus between America and Spain, and played a crucial role in the exchange of Phaseolus vulgaris seeds and their endosymbionts. The analysis of recA and atpD genes from strains nodulating this legume in coastal and inner regions of Hispaniola Island showed that they were almost identical to those of the American strains CIAT 652, Ch24-10 and CNPAF512, which were initially named as Rhizobium etli and have been recently reclassified into Rhizobium phaseoli after the analysis of their genomes. Therefore, the species R. phaseoli is more abundant in America than previously thought, and since the proposal of the American origin of R. etli was based on the analysis of several strains that are currently known to be R. phaseoli, it can be concluded that both species have an American origin coevolving with their host in its distribution centres. The analysis of the symbiovar phaseoli nodC gene alleles carried by different species isolated in American and European countries suggested a Mesoamerican origin of the α allele and an Andean origin of the γ allele, which is supported by the dominance of this latter allele in Europe where mostly Andean cultivars of common beans have been traditionally cultivated.
  • Item
    Assessment of bacterial populations associated with banana tree roots and development of successful plant probiotics for banana crop
    (2016-08) César A. Díaz Alcántara
    Doscientos sesenta y un aislados bacterianos asociados con las raíces de los árboles de banano en sistemas orgánicos se aislaron de 19 fincas ubicadas en cuatro provincias diferentes de la República Dominicana. Los aislados se analizaron mediante ARDRA más RAPD, y como consecuencia se seleccionaron 114 de ellos para su identificación mediante secuenciación completa del ARNr 16S y reconstrucción filogenética. Los 114 aislados pertenecían a 20 géneros diferentes, siendo Bacillus, Pseudomonas, Enterobacter y Stenotrophomonas los géneros predominantes. De estos, 65 aislados mostraron más del 99,5% de similitud con una cepa tipo, y se asignaron a 34 especies diferentes de 16 géneros; 29 aislamientos podían constituir nuevas especies y los 20 aislados restantes pertenecían a grupos que contenían más de una especie con genes idénticos de ARNr 16S, y por lo tanto no podían asignarse a ninguna especie. Este resultado mostró un mayor número de taxones bacterianos asociados con las raíces de los árboles de plátano que los descritos anteriormente. Además, encontramos siete especies bacterianas con una actividad significativa in vitro promotora del crecimiento de las plantas (PGP), que no se había descrito previamente como bacteria PGP en ningún cultivo. Los ensayos de campo con aislados preseleccionados en función de su actividad PGP in vitro mostraron que una cepa de la especie Pseudomonas plecoglossicida mejoró el rendimiento de la fruta y controló la incidencia de la enfermedad sigatoka negra causada por Mycosphaerella fijiensis. Esta actividad se atribuyó tentativamente a los mecanismos de resistencia sistémica inducida. La diversidad bacteriana se analizó entre los 261 aislados en base al índice de diversidad de Shannon (H), calculado a partir de los perfiles ARCuriosamente, la mayor parte de la diversidad bacteriana se encontró dentro de las granjas (86% del total), siendo mayor que la diversidad bacteriana entre las granjas (14%). Además, las diferencias en el índice H promedio entre provincias fueron muy bajas. En consecuencia, la biodiversidad de las comunidades bacterianas fue poco influenciada por las características del suelo. Estos resultados podrían favorecer la adaptación eficiente de las cepas bacterianas seleccionadas para su uso como probióticos vegetales en una serie de suelos de la región analizada.
  • Item
    Bradyrhizobium yuanmingense related strains form nitrogen –fixing simbiosis with Cajanuscajan L. in Dominican Republic and are efficient biofertilizers to replace N fertilization
    (2015-08) César A. Díaz Alcántara
    Cajanus cajan L. es una leguminosa cuyas semillas verdes se consumen en países caribeños como República Dominicana donde es una planta hortícola muy apreciada por los consumidores. En este trabajo se aislaron varias cepas rizobiales de crecimiento lento que ondulan C. cajan que se encontraron estrechamente relacionadas con Bradyrhizobium yuanmingense de acuerdo con el análisis de secuencias del gen 16S rRNA. Estas cepas eran genéticamente diversas sobre la base de sus patrones RAPD y mostraron una alta variabilidad en la capacidad de nodulación y la fijación de N en condiciones hidropónicas. Las cepas altamente efectivas utilizadas como biofertilizantes en cuatro suelos diferentes de República Dominicana mostraron que la biofertilización de C. cajan con estas cepas produjo el mismo o incluso mayor rendimiento que la fertilización con nitrógeno mineral. Por lo tanto, la biofertilización con cepas nativas de Bradyrhizobium se puede adoptar en lugar de la fertilización química para mejorar tanto el rendimiento como la calidad de C. cajan. Este es el primer informe sobre la nodulación de esta leguminosa por cepas cercanas a B. yuanmingense en República Dominicana donde la nodulación natural de C. cajan es escasa y luego, la biofertilización puede ser crucial para aumentar el rendimiento de este cultivo hortícola muy importante para la alimentación humana.
  • Item
    Bradyrhizobiumcajani sp. nov. Isolated from nodules of Cajanuscajan
    (2017-07-01) César A. Díaz Alcántara
    Two slow-growing strains, AMBPC1010T and AMBPC1011, were isolated from nodules of Cajanus cajan in the Dominican Republic. 16S rRNA gene analysis placed these strains within the genus Bradyrhizobium , being phylogenetically equidistant to several species of this genus. Analysis of the recA and atpD genes showed that the strains isolated belong to a cluster containing the strains Bradyrhizobium ottawaense OO99T, ‘ Bradyrhizobium americanum' CMVU44 and Bradyrhizobium daqingense CCBAU 15774T, and presented similarity values lower than 96 % for both genes with respect to the strains nodulating C. cajan. DNA–DNA hybridization analysis showed averages of 36, 40 and 39 % relatedness with respect to the representative strains of Bradyrhizobium ottawaense , ‘ Bradyrhizobium americanum' and Bradyrhizobium daqingense , respectively. Phenotypic characteristics also differed from those of the most closely related species of the genus Bradyrhizobium . Therefore, based on the data obtained in this study, we propose to classify the strains AMBPC1010T (=LMG 29967T=CECT 9227T) and AMBPC1011 into a novel species named Bradyrhizobium cajani sp. nov.
  • Item
    Inhibición de Mycosphaerella fijensis en banano orgánico (Musa AAA L.) con la aplicación de bacterias promotoras del crecimiento vegetal
    (2024-12) Iris Esther Marcano; César A. Díaz Alcántara; Ángel Radhamés Pimentel; Ángel Felipe Vicioso; Pedro Antonio Núñez Ramos
    El cultivo de banano orgánico (Musa AAAL.) contribuye al sustento de las familias, y a la economía a través de las exportaciones en República Dominicana. Las exportaciones de los productos agrícolas tienen limitantes; entre estas el límite máximo permitido de residuos químicos que presenten. Otras limitantes en la producción son la incidencia de plagas y enfermedades a nivel foliar. La principal enfermedad del banano es la Sigatoka (Mycosphaerella spp.), siendo la especiede importancia comercial lafijiensis. En plantaciones orgánicas se utiliza alternativas biológicas como control de enfermedades y las bacterias PGPRs son una alternativa por promover el desarrollo de plantas y controlar patógenos. El objetivo de la investigación fue evaluar el efecto de las bacterias PGPRs sobre el desarrollo de Mycosphaerella fijiensisin vitro. Se utilizaron veinte cepas bacterianas con capacidades PGPRs para el ensayo. Se aisló e identificó el hongo mediante reacción de la cadena polimerasa (PCR). El ensayo in vitrose llevó a cabo en medio de cultivo Papa Dextrosa Agar (PDA) en placa Petri con tres repeticiones por tratamiento, sembrando en el centro de la placa un disco de cada bacteria que se dejó crecer por 24 horas a 28 °C. Transcurrido el tiempo se inoculó el hongo,con una concentración aproximada de 1x105FM ml. El ensayo se incubó a temperatura de 28 ºC por 14 días. Los datos fueron analizados con el software estadístico Infostat (2018). Se identificó la especie M. fijiensis por PCR con iniciadores específicos. En el ensayo in vitropara control del crecimiento de Sigatoka, cuatro cepas inhiben el crecimiento DARA33 (Bacillus licheniformis), MTF12 (B. safensis), PMB10 (B. amyloliquefacienssubsp. plantarum) y MAM11 (Leclercia adecarboxylata) y dieciséis cepas no inhiben su crecimiento.
  • Item
    Two novel symbiovars of Bradyrhizobium yuanmingense, americaense and caribense, the symbiovar tropici of Bradyrhizobium pachyrhizi and the symbiovar cajani of Bradyrhizobium cajani are microsymbionts of the legume Cajanus cajan in Dominican Republic
    (2023-09) César A. Díaz Alcántara; Juan de la Cruz Araujo
    Cajanus cajan L. (guandul) is commonly cultivated in Dominican Republic where this legume is a subsistence crop. Here we identified through MALDI-TOF MS several rhizobial strains nodulating C. cajan in two Dominican locations as Bradyrhizobium yuanmingense. The phylogenetic analysis of recA and glnII housekeeping genes showed that these strains belong to a wide cluster together with the type strain of B. yuanmingense and other C. cajan nodulating strains previously isolated in Dominican Republic. The comparison of genomes from strains representative of different lineages within this cluster support the existence of several genospecies within B. yuanmingense, which is the major microsymbiont of C. cajan in Dominican Republic where it is also nodulated by Bradyrhizobium cajani and Bradyrhizobium pachyrhizi. The analysis of the symbiotic nodC gene showed that the C. cajan nodulating strains from the B. yuanmingense complex belong to two clusters with less than 90% similarity between them. The strains from these two clusters showed nodC gene similarity values lower than 90% with respect to the remaining Bradyrhizobium symbiovars and then they correspond to two new symbiovars for which we propose the names americaense and caribense. The results of the nodC gene analysis also showed that C. cajan is nodulated by the symbiovar tropici, which has been found by first time in this work within the species Bradyrhizobium pachyrhizi. These results confirmed the high promiscuity degree of C. cajan, which is also nodulated by the symbiovar cajani of Bradyrhizobium cajani in Dominican Republic.
  • Item
    Uso de bacterias autóctonas promotoras del crecimiento vegetal (PGPR) en el control de Mycospharella fijiensis en plantaciones de banano orgánico en la República Dominicana
    (2024-08) Iris Esther Marcano; César A. Díaz Alcántara; Ángel Radhamés Pimentel; Ángel Felipe Vicioso; Pedro Antonio Núñez Ramos
    La producción de banano orgánico (Musa AAAL.) es uno de los principales productos de exportación de la República Dominicanaal mercado de EE. UU. y Europa. Este cultivo se ve afectado aproximadamente en un 50 % del área foliar, por la enfermedad Sigatoka negra agente causal Mycosphaerella fijiensis Morolet. El control de esta enfermedad con agroquímicos es común, esto restringe su carácter orgánico y la factibilidad de comercialización, lo que trae como consecuencia dificultades para su control. El objetivo fue el uso de bacterias autóctonas promotoras del crecimiento vegetal (PGPR) en el control de Mycosphaerella fijiensisen plantaciones de banano orgánico. Se utilizó un diseño experimental de bloques completos al azar con cuatro tratamientos y cuatro repeticiones. Los tratamientos fueron tres bacterias (MAM21, DARA33 y MOSY21) y un testigo; y se evaluaron 10 plantas/tratamiento. Las plantas fueron inoculadas en vivero con un caldo bacteriano a razón de 20 ml c/u, a una concentración aproximada 6x108 UFC ml-1, una semana antes de la siembra. Se midieron las variables indicadoras de evolución de la enfermedad Sigatoka negra correctivo evolución (CE), suma bruta (SB), suma evolutiva (SEV), estado evolutivo (EE). Desarrollo: altura de la planta (AL), grosor del pseudotallo (PS), número de hojas (NH) y productividad del banano: peso del racimo, grado del dedo. Se realizaron los análisis estadísticos ANOVA, Test de Duncan y Análisis de Componente Principal (ACP). Los resultados muestran al tratamiento MOSY21 (P. plecoglossicida)con estado evolutivo de la enfermedad Sigatoka negra en cero en diferentes semanas, así como mejor desarrollo de la planta y productividad. Estas bacterias pueden ser usadas en el fomento de la agricultura orgánica ya que, ayudan a mejorar el desarrollo de las plantas y la productividad