(Proyecto) Bioprospección de microbiomas y extremoenzimas mediante técnicas metagenómicas con potencial aplicación Biofarmacéutica.
(Proyecto) Bioprospección de microbiomas y extremoenzimas mediante técnicas metagenómicas con potencial aplicación Biofarmacéutica.
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Date
2026
Authors
Alfaniris Vargas
Adrián Gutiérrez
Ramón Alberto Batista García
Sonia Dávila Ramos
Manuel Vásquez Tineo
Journal Title
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Publisher
Abstract
Las técnicas metagenómicas, basadas en el estudio de alto flujo de ADN, son un poderoso enfoque para estudiar la biodiversidad en entornos naturales, ya que las técnicas dependientes de cultivo sólo permiten recuperar menos del 1% de la biodiversidad microbiana total. La ecología molecular utiliza aproximaciones metagenómicas para el estudio de las comunidades virales, bacterianas y de hongos; así como para evaluar sus potencialidades metabólicas (enzimas y proteínas). A través del estudio de librerías metagenómicas se pueden identificar clonas con candidatos enzimáticos novedosos y con alta potencialidad de aplicación biotecnológica. Las enzimas lignocelulolíticas son valorizadas de acuerdo a su utilidad para la degradación de biomasa. En República Dominicana los estudios metagenómicos son muy limitados, y no existen publicaciones en el área. El presente proyecto estudiará la diversidad del microbioma y del viroma en el Lago Hipersalino Enriquillo ubicado en las Provincias Independencia y Bahoruco de República Dominicana. Para ello se colectarán muestras de agua de diferentes profundidades y sedimento, se aislará el ADN metagenómico, para posteriormente preparar librerías clonales y secuenciar el metagenoma. Se analizarán bioinformáticamente las secuencias para establecer perfiles de biodiversidad.. Por primera vez se estudiarán en el país, desde el punto de vista metagenómico, poblaciones virales y fúngicas Y se realizarán escrutinios para la búsqueda de celulasas, esterasas, lacasas y xilanasas que resulten novedosas para la degradación de lignocelulosa. Este proyecto también generará información relevante sobre las relaciones ecológicas, evolutivas, metabólicas y geoquímicas de las poblaciones microbianas y virales del Lago Enriquillo, con el objetivo de crear e impulsar un laboratorio de referencia nacional y regional para el Caribe en el ámbito de las ciencias genómicas y estudios globales ómicos. Este estudio será el primer intento nacional por estudiar nuestro patrimonio de biodiversidad de ambientes.
Description
Objetivo General:
Analizar mediante estudios metagenómicos el metagenoma del Lago Hipersalino Enriquillo en términos del análisis de su potencial biotecnológico enfocado a la búsqueda de enzimas de utilidad biofarmacéutica
Objetivos específicos:
1. Colectar muestras de agua y sedimento del lago y procesarlas a fin de obtener muestras enriquecidas en microorganismos y virus mediante métodos de filtración.
2. Extraer el conjunto de ADN metagenómico característico de la composición de las muestras.
3. Obtener librerías metagenómicas a partir de los microbiomas y viromas.
4. Secuenciar el ADN metagenómico mediante NGS con la plataforma Illumina.
5. Realizar el análisis de la biodiversidad (viroma, bacterias y hongos) mediante herramientas bioinformáticas.
6. Analizar las librerías metagenómicas para la búsqueda de actividades enzimáticas involucradas en la degradación de lignocelulosa (celulasas, esterasas, lacasas y xilanasas).
7. Caracterizar bioquímicamente las enzimas encontradas en las librerías metagenómicas.